Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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LRRC38Q5VT99 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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LRRC38Q5VT99 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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LRRC38Q5VT99 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC38Q5VT99 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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