Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms