Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms