Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms