Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms