Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-3Q3SY46 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms