Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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