Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms