Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms