Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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