Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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