Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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