Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXT1Q16394 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms