Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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