Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NPTX1Q15818 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NPTX1Q15818 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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