Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms