Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms