Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms