Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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