Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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RFTN1Q14699 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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