Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DDX39BQ13838 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DDX39BQ13838 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DDX39BQ13838 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DDX39BQ13838 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DDX39BQ13838 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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