Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms