Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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