Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms