Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms