Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms