Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms