Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms