Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms