Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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NFIAQ12857 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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NFIAQ12857 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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NFIAQ12857 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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NFIAQ12857 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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NFIAQ12857 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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NFIAQ12857 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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NFIAQ12857 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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