Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP160Q12769 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP160Q12769 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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