Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms