Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms