Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms