Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms