Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms