Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPCAP84074 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPCAP84074 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPCAP84074 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPCAP84074 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPCAP84074 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms