Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP9P55211 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP9P55211 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP9P55211 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms