Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB28P51157 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms