Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms