Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms