Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT2P45379 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms