Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRATP43155 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms