Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms