Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms