Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms