Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms