Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms