Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms