Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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